Разработка ЭВМ «Киев» началась в 1954 году, в той самой лаборатории, где под руководством С. А. Лебедева была создана ЭВМ «МЭСМ»; разработку выполнял тот же самый коллектив. Непосредственным инициатором разрботки был Б. В. Гнеденко, в то время — директор Института математики АН УССР.

Первый экземпляр ЭВМ был установлен в Вычислительном центре Академии наук УССР, второй — в Объединённом центре ядерных исследований в Дубне).

В 1960 году, впервые в мире, с помощью ЭВМ «Киев» проводились эксперименты по дистанционному управлению технологическими процессами